소재에 대한 비판
함대 컬렉션이라는 게임 자체가 태평양 전쟁 당시 일본군 함선을 의인화한 것이라, 이 게임이 실제 우익적 색채를 담고 있는지와는 상관없이 역사인식 논쟁에서 자유로울 수는 없다.
히요의 미드웨이 해전 관련 복수 발언 등으로 심해서함이 연합군 함선을 모티브로 한 것이 아닌지 하는 의혹도 있다. 심해서함의 경우 장비가 인치 단위로 표시되는 점, 각 해역이나 원정의 이름이 명백히 과거 일본군의 전투에서 가져온 것임을 볼 때 이러한 의혹은 상당한 정도로 신빙성이 있다고 할 수 있다. 그러니까 빨리 연합군 칸무스를 내놔
이8이나 토네같은 함선에서 전쟁 범죄가 자행된 역사에 대해선 함구함으로서 이중잣대의 논란도 있다.