국가안전국 (NSS)
- 김현준 (이병헌) : 시즌 1 주인공. 707 특수부대 출신인 현준은 국장이 된 '백산'의 부탁으로 북한 고위 간부 1명을 암살한다. 그러나 절친이었던 '진사우'와 '백산'의 배신으로 인해 간첩 혐의가 씌워지고 사망 처리가 되고 만다. 그렇게 러시아와 일본을 전전하며 한국에 돌아올 기회를 엿본다. 그러다 자신을 도와준 소녀 '유키'와 그 일가족이 몽땅 죽는 사건이 발생한다. 그 진범은 의문의 테러단체 '아이리스'의 킬러 '빅'. 빅을 통해 '진사우'와 '백산'이 아이리스의 관련자라는 것을 알게 되면서 '김선화'와 함께 한국에 돌아와서 핵 테러를 저지 한다. 그 덕분에 '조명호' 대통령의 신임을 한번에 얻어 사면 조치가 되고, NSS에 돌아와 아이리스를 막기 위해 온 힘을 건다.
- 최승희 (김태희) : '김현준'의 연인. 시즌 1 여주인공. '현준'이 경비행기 추락으로 사망했다는 소식을 들었을 때 자신은 그 말을 믿지 않았다. '현준'은 누구보다 뛰어난 요원으로 비행기 추락에 대해서도 잘 대처한다고 믿기 때문. 그러던 어느 날, NSS가 북한 강경파 테러범들에 의해 점거 당했을 때 거기에 위장 중인 '현준'과 마주치게 되고, 믿음이 확신으로 변한 순간 뒤에서 '현준'을 도와준다. 그렇게 '현준'이 NSS로 복귀하자 '현준'을 쉬게 해 주고자 같이 제주도로 휴가를 간다. 그런데 그 후로 뭔가 숨기는 게 있는 듯 속내가 좀 어두워 보인다.
- 박상현 (윤제문) : 시즌 1 NSS 대 테러 실장. '현준'과 '승희'의 직속상관이면서 '진사우'의 고향 선배인 상현은 정년 퇴직까지 버티다가 은퇴 후 연금 받으며 사는 것을 목표로 하고 있어서 인지 위험한 상황이 발생하는 테러 현장 출동을 엄청 싫어한다. 그래도 사람을 지키는 일은 해야 해서 종종 현장에 나가기도 한다. 북한 테러범을 쫓느라 바쁘던 어느 날, 과학수사실장인 '오현규 실장'에게서 '진사우'가 수상하다는 이야기를 듣고 '최승희'와 함께 뒷조사를 시작한다. 그러다 국장인 '백산'이 자신을 어처구니 없는 반역 죄로 잠시 가두면서 '백산'도 '진사우'와 한패라는 것을 알아 챈다. 그러나 상관인 '황태윤 실장' 덕분에 풀려나고 살아 돌아 온 '현준'이 NSS에 복귀하면서 의문의 테러단체 아이리스에 맞서면서 그 조직의 일원인 '빅'을 추적한다.
- 양미정 (현쥬니) : 시즌 1 NSS 해커 요원. 과거 대학 시절 카드 빚 몇 백 만원을 해결하기 위해 은행 Data Base를 해킹해 고객 DB를 몽땅 갈아엎었던 장본인. 지금은 NSS에서 천재 해커 요원으로 일하고 있으며 요원들의 작전을 재빨리 알아 차려 첩보원들에게 정보를 알아 차려 주는 미정은 평소에는 말이 없으나 '현준'과 '승희'의 부탁이라면 든든히 들어주는 조력자이다. 그러나 4달 전 부터 아이리스의 킬러인 '빅'과 모종관계를 펼치지만, '빅'에 의해 토사구팽 식으로 즉사한다.
- 양정인 (김혜진) : NSS 자료실장. '최승희'의 절친.
- 황태성 (김대진) : 시즌 1 NSS 상황실 요원.
- 정유건 (장혁): 시즌 2 주인공. 고등학교 시절 싸움닭에서 어른이 되어서는 형사로 일하던 유건. 어느 날 NSS 소속인 '박준한'과 NSS 만난다. 처음에는 시작이 좋지 않았지만 '준한'이 자신의 배짱을 알아보고 그의 선처로 NSS TF-A 팀 팀장이 된다. 하지만 동료였던 '준한'은 아이리스에 의해 죽고, 자신도 아이리스에 의해 총을 맞고 기억을 잃어 아이리스 멤버로 활동하기도 했다. 하지만 기억이 돌아오면서 다시 NSS에 돌아오게 되고 한국 정부에서 사면을 받은 후 그림자 요원으로 부활하여 NSS를 지원해주는 중이다. 그러나 자신의 아버지 '유상준'이 바로 '백산' 이라는 것을 알게 되는데...!
- 지수연 (이다해): '정유건'의 연인, NSS TF-A 팀 요원. 시즌 2 여주인공. 과거 '유건'이 싸움 닭이었을 때도 항상 곁에 있어준 수연. 지금은 '유건', '현우'와 함께 NSS TF-A 팀을 운영해가면서 살갑게 지내고 있다. 여자라고 봐주는 것은 딱 질색이고, 입는 옷도 검정 색을 좋아하는 녀석. 그러다 눈 앞에서 '유건'의 실종을 목격하게 되고 그 뒤를 이어서 TF-A 팀 팀장이 되었지만 그간 있었던 열정은 조금씩 식어져 간다. 그러다 기억이 돌아온 '유건'을 보게 되고 '유건'의 부탁이라면 뭐든 들어주는 든든한 대인배인 순정녀.
- 서현우 (윤두준): NSS TF-A 팀 요원, '지수연'의 친구. 뒤에서 '수연'을 짝사랑하기를 꾸는 녀석이지만 '수연'이 '유건'에게 마음이 더 가있다는 것을 현우는 잘 알고 있다. 그러다 팀장이었던 '유건'이 실종 되고 힘들어 하는 '수연'을 뒤에서 지켜준다. 그러던 어느 날, 기억이 돌아온 '유건'을 만난다. 뒤에서 그저 지켜보기도 하지만, 때로는 '수연'에 대한 사랑을 양보 못하는 감시자가 되기도 한다. 그런데 아이리스의 멤버인 '윤시혁'에 의해 스파이로 몰릴 위험에 처하지만 운 좋게도 NSS에 복귀한다.
- 최민 (오연수): 시즌 2 한정 NSS 부국장.
- 강병진 (백성현): 시즌 2 NSS 해커 요원.
- 박준한 (성동일): 시즌 2 NSS 대 테러 실장.
- 오현규 실장 (윤주상): NSS 과학수사실장. 시즌 1, 2 모두 출현한 몇 안 되는 인물 중 1명. NSS 내에서 최고령자로 통하는 현규는 컴퓨터가 도입되기 전부터 과학 수사를 잘해 왔다. 그래서 인지 그의 실력은 미국에서도 알아봐 주는 것은 물론이고 NSS 내에서도 과학 수사 1인자로 손꼽히는 인물이다. 평소에는 시체처럼 낮잠을 자거나, 아니면 주식 사이트를 즐긴다든지, 신입 요원들을 장난 삼아 구박하는 등 성격이 워낙 괴팍하고 좀 수다스럽다. 그래도 과학 수사에서 1인자라는 것은 변함이 없다. 그리고 3 년후, 시즌 2 에서도 재 등장. 까짓 NSS 관둬도 아깝지 않다고 말하곤 하면서, 부국장으로 부임한 '최민'의 지시를 유독 많이 받기도 한다. '백산'에게서 받아온 핵폭탄을 조사해주고, NSS에 돌아온 '정유건'의 상태를 종종 알아봐 주고 있다. 그런데 아이러니 하게도 '백산'에 대해 시사하는 바가 좀 큰지 '백산'의 사망 소식을 전하게 되는데...
- 유혜영 (차현정): NSS 상황실 팀장. 똑 부러지게 냉정한 성격으로 날카로운 상황 파악을 자랑하는 인물.
- 김지헌 (이승학): NSS 암호해독요원. 강병진의 절친. 평소에는 상황실에서 일하지만 종종 현장에 투입되는 요원.
- 표진환 (전재형): 시즌 2 NSS 상황실 요원.
- 상진: 시즌 2 NSS 상황실 요원.
- 미진: 시즌 2 NSS 상황실 요원.
- 황태윤 실장 (백신): NSS 내사실장. 시즌 1, 2 모두 출연한 몇 안 되는 인물 중 1명.
한국 정부
- 조명호 대통령 (이정길):
- 정형준 (정한용):
- 유강호 (박용기):
- 하승진 대통령 (조성하):
북한
- 박철영 (김승우):
- 유중원 (이범수):
- 김선화 (김소연):
- 김연화 (임수향):
- 리혁수 (박세준):
- 박태희 (윤소이):
- 연기훈 (최종환):
- 강도철 (장동직):
아이리스 (IRIS)
- 유정철 (김갑수);
- 백산 (김영철):
- 빅 (T. O. P):
- 레이 (데이비드 맥기니스):
- 윤시혁 (이준):
- 유진 (고윤):
- 마성식:
- 이수진 (윤주희):
기타
- 유정훈 (김갑수) :
- 진사우 (정준호)
- 사토 에리카 (유민)
- 정수민 (이보희)