오픈바벨

오픈바벨(Open Babel)은 주로 화학 파일 형식을 상호 변환하는 데 사용되는 화학 전문가 지원 프로그램인 컴퓨터 소프트웨어이다. GPL(GNU General Public License) 2.0에 따라 출시된 무료 오픈 소스 소프트웨어로 잘 알려져있다. 프로젝트의 명시된 목표는 다음과 같다. "오픈 바벨(Open Babel)은 파일 형식과 데이터의 상호 변환을 포함하여 분자 모델링, 화학 및 많은 관련 영역을 지원하도록 설계된 교차(cross) 플랫폼 프로그램 및 라이브러리로서 사용자와 개발자 모두를 지원하는 커뮤니티 주도 과학 프로젝트입니다." [1]

사용 예[편집 | 원본 편집]

펍켐(PubChem)등에서 제공하는 sdf 파일을 svg 파일로 전환하는 경우

> obabel Structure2D_CID_5281769.sdf -O Structure2D_CID_5281769.svg

한편 .mol파일 형식도 지원하고 있다. 오픈바벨은 켐스파이더(ChemSpider)의 .mol파일 형식을 .svg파일형식으로 변화하는것뿐만아니라 다양한 화학파일 형식을 지원하고있다.[2]

3D[편집 | 원본 편집]

3D파일을 평면 그래픽 svg 파일로 변환하는 경우

> obabel Conformer3D_CID_6267.sdf -O Conformer3D_CID_6267.svg -xS

설치 예[편집 | 원본 편집]

우분투의 경우

> sudo apt-get install openbabel

터미널 환경에서 자동설치를 지원한다.[3] 이외에도 MS윈도우즈(MS Windows), 유닉스(Unix), 리눅스(Linux)배포판들, 맥(macOS) 및 안드로이드(Android)에서도 지원한다.

연관[편집 | 원본 편집]

각주

  1. [참고](Open Babel: The Open Source Chemistry Toolbox)http://openbabel.org/wiki/Main_Page , [참고](Open Babel Documentation)https://buildmedia.readthedocs.org/media/pdf/open-babel/latest/open-babel.pdf, [참고](Open Babel ,Open Babel v2.3.1 documentation - Install Open Babel )https://openbabel.org/docs/dev/Installation/install.html
  2. [참고](Open Babel v2.3.0 documentation-Supported File Formats and Options)http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Overview.html
  3. 우분투 20 LTS